A mezőgazdasági termelésben alkalmazott külső anyagok bevitelére vonatkozó szigorúbb szabványok és korlátozások ellenére a bio-mezőgazdaságban továbbra is számos olyan terméket használnak, amelyek az Európai Unió biotermékekre vonatkozó előírásai alapján kizárólag a gazdasági és technikai értelemben megfelelő alternatívák hiányában engedélyezettek. Ezek közül néhánynak az alkalmazása aggodalomra ad okot, vagy pedig egyáltalán nincs összhangban a biogazdálkodás alapelveivel. A legellentmondásosabb gyakorlat e tekintetben a réz, mint növényvédelmi termék alkalmazása, de a nem biogazdaságokból származó trágya, az állattenyésztésben használatos mesterséges vitaminok és provitaminok és a növényvédelmi célú ásványi olajok alternatívájára is sürgető igény mutatkozik.

A projekteknek minden részletre kiterjedő áttekintést kell adniuk a különböző típusú bio-növénytermesztési és -állattenyésztési rendszerekben jelenleg alkalmazott és szükséges külső anyagok bevitelére vonatozóan. A megvalósított tevékenységeknek a vitatható anyagok bevitelének csökkentésére, illetve használatból történő fokozatos kivonására kell összpontosítaniuk, anélkül, hogy a bioágazat versenyképességére negatív hatást gyakorolnának. A projektek keretében a károsanyag-bevitel alternatíváinak azonosítása, illetve fejlesztése valósul meg, valamint az alkalmazásukat elősegítő társadalmi-gazdasági feltételek elemzésére is sor kerül. A kidolgozott termékeket, illetve menedzsment-gyakorlatot különböző talaj- és éghajlati adottságok, illetve mezőgazdasági körülmények között kell kipróbálni.